Mesoskalige Modelle sind zumeist für bestimmte Anwendungen spezialisiert (z.B. die lokale Wettervorhersage, Prozessstudien). Am Institut werden daher verschiedene mesoskalige Modelle für unterschiedliche Anwendungen verwendet (z.B. die Eigenentwicklungen MESOSCOP und REWIH3D, das Modell LM des Deutschen Wetterdienstes und das Modell MM5 des NCAR). Weitere wichtige Anwendungen mesoskaliger Modelle sind z.B. lokale Starkniederschlagsereignisse, konvektive Stürme, und regionale Klimastudien.