Seit 2007 unterstützt das BMBF mit dem Förderschwerpunkt „Hochschulforschung“ den Auf- und Ausbau der Forschung über Hochschulen. Das deutliche Missverhältnis zwischen der zunehmenden Verwissenschaftlichung aller Lebens- und Arbeitsbereiche einerseits und der geringen systematischen Beschäftigung mit internen und externen Faktoren wissenschaftlichen Wissens andererseits soll damit behoben werden.Trotz der dynamischen Entwicklung der Hochschulforschung in den vergangenen Jahren ist die Forschungslage bisher – gemessen am Umfang der vorhandenen Forschungskapazitäten, am Grad ihrer Institutionalisierung oder am Wissenstransfer in die Praxis der Hochschulen – noch unzureichend; gleichzeitig steigt die Nachfrage nach wissenschaftsbasiertem Grundlagenwissen zu dem Geschehen an Hochschulen deutlich. Mit der gezielten Förderung von Forschungsprojekten soll sichergestellt werden, dass zukünftig die notwendigen Modernisierungs- und Reformmaßnahmen mit einer adäquaten wissenschaftlichen Begleitung stattfinden können. Übergeordnetes Ziel des Förderschwerpunktes „Hochschulforschung“ ist es außerdem, vorhandene FuE-Kapazitäten zu stärken sowie zusätzliche Kapazitäten aufzubauen.
Die Förderung im Rahmen der Hochschulforschung gliedert sich derzeit in drei Förderlinien: